BARU BELAJAR

Pak, laporan praktikum BSM dah saya upload di page praktikum..tinggal di download..trimakasih..

NYOBA

PAKE GBR

Mekanisme Biokimia Inisiasi dan Terminasi Dari Replikasi DNA Plasmid

Lebih dari 40 tahun yang lalu, Jacob et al telah menyatakan bahwa replikasi pada cromosom prokariot diatur secara otonom dan masing masing unit replikasi dinamakan replicon, Pada kebanyakan bakteri yang jauh lebih kecil dan sederhana hanya memiliki satu kromosom Plasmid merupakan DNA sirkuler untai ganda diluar kromosom yang dapat melakukan replikasi sendiri. Plasmid dapat merubah karakteristik bakteri, sehingga bakteri dapat resisten terhadap antibiotiknya.

.Tempat dimulainya proses inisiasi (permulaan )dari proses replikasi pada plasmid terjadi di suatu tempat yang dinamakan origin of replication (ori). plasmid mempunyai kemampuan untuk bereplikasi sendiri dalam tubuh inang sehingga dalam rekombinan DNA ini sering sekali DNA yang diinginkan disisipkan ke DNA plasmid dengan harapan DNA yang diinginkan ini akan diperbanyak saat replikasi plasmid. Plasmid bakteri merupakan molekul DNA sirkular yang kecil dan bereplikasi secara indipenden pada genome inang serta mengkode antibiotik resisten. Plasmid ini biasanya banyak digunakan sebagai vektor untuk kloning DNA. Beberapa plasmid dapat bergabung dengan DNA kromosom dan kemudian dapat dipotong lagi dengan tepat pada peristiwa rekombinasi. DNA plasmid hanya berukuran 1.000-100.000 pasang basa. Plasmid membawa informasi genetik dan mengalami replikasi untuk menghasilkan plasmid yang identik dan diturunkan selama pembelahan sel.

Beberapa plasmid tidak memberikan manfaat pada inangnya, namun beberapa plasmid yang lain membawa gen yang mengakibatkan bakteri resistan terhadap antibiotik.

Salah satu contoh plasmid yang biasa diteliti proses replikasinya adalah R6K yang umumnya ditemukan di dalam usus manusia.

Beberapa peneliti meneliti bahwa R6K mempunyai 3 titik awal replikasi yaitu ori α, ori β dan ori γ. Pada kromosom tertentu, hanya salah satu saja yang aktif dari 3 titik tersebut.

Prosesnya membutuhkan protein yang dinamakan pi yang dihasilkan atau di kode oleh R6K itu sendiri. Protein pi tersebut nantinya akan mengikat semua tiga titik ori tersebut. Plasmid yang mengkode inisiasi pada protein pi mengikat secara spesifik sampai dengan tujuh tandem sequence secara berulang yang disebut interons pada ori γ Pengikatan dari protein pi ke γ interon yang dikolaborasikan dengan pengikatan protein IHF (Intergration Host Factor) dan inisiasi bakteri menyebabkan mencairnya daerah AT rich yang berada didekat interons dan membuka secara kompleks, kemudian mengambil replicative helikase DNaB dan replikasi dari protein lain seperti 10 sub unit holoenzyme DNA polymerase III dan primase DNaG dari replisome. Pemasangan replisom salah satu dari dua pada inisiasi replikasi γ berada diantara α dan β. α dan β masing masing berada pada jarak 4000 dan 1200 bp dari 7 interns pada γ. Replikasi pada beberapa kromosom silkuler prokariot dan beberapa bagian dari rDNA pada yeast sampai pada manusia, maka akan terjadi penangkapan sekuens pendek DNA dan akan mengakhiri replikasi. Tempatnya terjadi di kutub dimana nantinya akan menangkap garpu replikasi dari titik ori yang terbentuk dari proses inisiasi dimana saling memisahnya ke dua untai DNA yang tiap untainya berperan menjadi template untuk pembentukan DNA baru. Sequens tersebut dinamakan Ter situs dan yang mengikat protein dinamakan Tus yang juga menangkap kode perkembangan dari replicative helicase DnaB (ATP dependent yang mengendalikan pada saat pembentukan garpu replikasi)

Situs terkait : http://www.ias.ac.in/currsci/jul252005/329.pdf

Wuih……ini pengalaman pertama buat blog..susah??ga juga…..ribet?iya banget…..ternyata membuat blog tak segampang membuat situs pertemanan ya sebut saja facebook atau friendster…tapi berkat bimbingan sodara rizky yach finally ini blog rampung juga..walopun acak acakan tapi yang namanya baru belajar ya mohon dimaklumi ya….hahahahahaha….anyway..blog ini aku buat si tujuan utamanya untuk memenuhi tugas terstruktur mata kuliah biologi sel dan molekuler yang di ampu oleh Dr. Hendra Pramono MS dan Ir Alice Y. Ph. D tapi mungkin seiring berkembangnya waktu….ciyeelah….mudah mudahan blog ini bisa bermanfaat dengan artikel2 yang nantinya akan aku upload……aminnnnnnnnn.. untuk temen2 pasca sarjana bilogi unsoed 09 :mas atang, Pak Royo, Pak Muslich, Pak Ma’ruf, Pak Abdillah (kok ga pnah masuk kuliah si pak…..hehehehhehe), mas udit, mas wawan, jeany, aulid, yuita,jojo, mba ilah (smoga nanti lahiran bayinya bisa lancar ya mba….aminn) smoga tetep kompak da semangat selalu..jangan lupa tugas2 terstrukturnya pada dikerjain……udah pada deadline ni……..ayo…..semangat…